国际物流在实际运作中存在多方面的缺点。首先是价格方面，国际物流成本通常较高。其运输涉及多种方式，海运虽成本相对低但耗时久，空运速度快却费用高昂，而且还需考虑关税、增值税等额外费用。不同国家的关税政策差异大，比如某些国家对特定商品征收高额关税，这使得最终的物流价格难以精准预估，对于企业控制成本形成较大压力，尤其对于小型企业而言，较高的物流价格可能削弱其国际市场的价格竞争力。

其次是流程复杂。国际物流涵盖出口国的备货、包装、报关、商检，以及运输途中的订舱、航线安排，还有进口国的清关、配送等多个环节。以报关为例，需要准备详细准确的报关单、发票、装箱单等资料，且要严格遵循出口国和进口国的海关规定，任何一个环节出现疏漏，如资料填写错误、单证不齐等，都可能导致货物滞留港口，耽误交付时间，增加物流操作的难度与风险。

再者是资料要求严格。国际物流需要准备众多相关文件，像原产地证书用于确定关税待遇，商业发票是交易的重要凭证，提单是货物所有权凭证等。不同国家对这些资料的格式、内容有细致要求，例如原产地证书的出具机构、填写内容都有明确规范，企业稍有不慎就可能因资料不符合要求而无法顺利通关，而且资料准备过程繁琐，需要企业投入大量精力去确保资料的准确性与完整性，这对于一些企业来说是不小的挑战。

此外，国际物流受国际形势影响显著。国际海运航线可能因战争、港口拥堵等情况受阻，导致运输时间大幅延长，货物交付不确定性增加。同时，汇率波动也会影响物流成本，当本币汇率波动时，企业的物流费用可能随之变化，带来额外财务风险，这些都使得国际物流的稳定性较差，难以精准把控物流进程。